সুপ্রিম কোর্টে ধাক্কা খেলেন অভিষেক ব্যানার্জি। বিচারপতি অভিজিৎ গঙ্গোপাধ্যায়ের মন্তব্যের বিরোধীতা করে সুপ্রিম কোর্টের দ্বারস্থ হয়েছিলেন তৃণমূল সাংসদ। শীর্ষ আদালতের কাছে তিনি আবেদন করেন যে বিচারপতির মন্তব্যের পরিপ্রেক্ষিতে তদন্ত প্রভাবিত হচ্ছে। এর পাশাপাশি তৃণমূলের সাংসদ আরও দাবি করেন যে সুপ্রিম কোর্ট হাই কোর্টের প্রধান বিচারপতিকে নির্দেশ দিক একটি আলাদা বেঞ্চ গঠন করার জন্য, যেখানে অভিজিৎ গঙ্গোপাধ্যায়ের বেঞ্চ থেকে বিচারপতি অমৃতা সিনহার বেঞ্চে যাওয়ার মামলা গুলোর শুনানি হবে। অভিষেকের আবেদন থেকে স্পষ্ট যে সে চাই ছিল যাতে বিচারপতি গঙ্গোপাধ্যায়ের মতো বিচারপতি সিনহার বেঞ্চে থেকে নিয়োগ দুর্নীতি এবং লিপ্স এন্ড বাউন্ডস সংক্রান্ত মামলা গুলো সরিয়ে নেওয়া হয়। বিচারপতি গঙ্গোপাধ্যায়ের বিরুদ্ধে কঠোর পদক্ষেপ নেওয়ার আবেদনও করেন তিনি।

কিন্তু শীর্ষ আদালত তৃণমূল সাংসদের এই আবেদনকে ভিত্তিহীন বলে অগ্রাহ্য করেছে এবং তা খারিজও করে দিয়েছে। 

সম্প্রতি অভিষেক ব্যানর্জির বিপুল আয় এবং তার উৎস নিয়ে মন্তব্য করেন বিচারপতি অভিজিৎ গঙ্গোপাধ্যায়। বিচারপতির সেই মন্তব্যকে কেন্দ্র করেই সুপ্রিম কোর্টের দ্বারস্থ হন অভিষেক।